秦始皇二十六年（公元前221）置商县。隋开皇四年（584）更名商洛县。金贞元二年（1154）县废。1915年设商县分县，1931年废。1947年分商县、洛南、山阳三县地于龙驹寨设立龙驹设治局。
1949年改设为丹凤县。因县城南临丹江、北依凤冠山而得名。1950年属商洛专区。1958年撤销县制，辖地分别划入商县、商南县、山阳县。1961年改丹凤县。1969年属商洛地区。2001年属商洛市。
1996年，丹凤县面积2438平方千米，人口29万人。辖7个区公所，3镇40乡：龙驹寨镇、铁峪铺镇、商镇镇、茶房乡、棣花乡、大峪乡、留仙坪乡、庵底乡、寺坪乡、牌楼河乡、毛里岗乡、花园乡、竹林关乡、张家塬乡、东岭乡、西岭乡、古路河乡、土门乡、石槽沟乡、龙王庙河乡、桃花铺乡、苏沟乡、花瓶子乡、白阳关乡、东毛坪乡、武关乡、梨园岔乡、北赵川乡、炉道乡、蔡川乡、南石门乡、庾家河乡、峦庄乡、马家坪乡、黄柏岔乡、桃坪乡、峡河乡、西河乡、河南乡、月日乡、资峪乡、双槽乡、涌峪乡。县政府驻龙驹寨镇。
1997年，撤销商镇、寺坪、竹林关、铁峪铺、峦庄、庾岭、凤冠等7个区公所建制，撤销西河乡、河南乡并入龙驹寨镇，撤销桃花铺乡并入铁峪铺镇，撤销茶坊乡、棣花乡合并设立棣花镇，撤销东毛坪乡、武关乡合并设立武关镇，撤销黄柏岔乡、峦庄乡合并设立峦庄镇，撤销炉道乡、庾家河乡合并设立庾岭镇，撤销庵底乡、蔡川乡合并设立蔡川镇，撤销牌楼河乡、寺坪乡合并设立寺坪镇，撤销龙王庙乡、土门乡、古路河乡合并设立土门镇，撤销张塬乡、竹林关乡、西岭乡合并设立竹林关镇，撤销苏沟乡并入花瓶子乡，撤销梨园乡并入北赵川乡，撤销南石门乡并入马家坪乡（此处待考证；原南石门乡辖区现在属庾岭镇）；撤销峡河乡，将其辖区的金湾、银坪、双峰3个村委会划归桃坪乡管辖。调整后，丹凤县辖11个镇、15个乡：龙驹寨镇、铁峪铺镇、商镇、棣花镇、大峪乡、留仙坪乡、寺坪镇、毛里岗乡、花园乡、竹林关镇、东岭乡、土门镇、石槽沟乡、花瓶子乡、白阳关乡、武关镇、北赵川乡、蔡川镇、庾岭镇、峦庄镇、马家坪乡、桃坪乡、月日乡、资峪乡、双槽乡、涌峪乡。
2000年第五次人口普查，全县总人口295833人，其中：龙驹寨镇51413人，竹林关镇16755人，土门镇13410人，寺坪镇9131人，棣花镇21228人，商镇镇18605人，铁峪铺镇17390人，武关镇10505人，峦庄镇10893人，庾岭镇12223人，蔡川镇9237人，东岭乡4415人，石槽沟乡4548人，毛里岗乡4395人，花园乡5134人，大峪乡9027人，留仙坪乡6448人，月日乡8582人，涌峪乡6535人，双槽乡7923人，资峪乡9748人，花瓶子乡10311人，白阳关乡4179人，北赵川乡7692人，桃坪乡7028人，马家坪乡9078人。
2001年，撤销涌峪乡并入龙驹寨镇，撤销马家坪乡并入峦庄镇，撤销白阳关乡并入武关镇，撤销石槽沟乡并入竹林关镇，撤销大峪乡并入商镇镇。调整后，丹凤县辖11个镇、10个乡：龙驹寨镇、庾岭镇、蔡川镇、峦庄镇、铁峪铺镇、武关镇、竹林关镇、土门镇、寺坪镇、商镇镇、棣花镇、月日乡、双槽乡、资峪乡、桃坪乡、花瓶子乡、北赵川乡、东岭乡、毛里岗乡、花园乡、留仙坪乡。
2009年？，全县辖21个乡镇，208个村，1823个村民小组，75653户，301582人，农业人口276518人，县城龙驹寨人口约5万人。
2011年，撤销双槽乡、资峪乡合并设立资峪镇，撤销留仙坪乡并入商镇镇，撤销东岭乡并入竹林关镇，撤销花园乡、毛里岗乡并入寺坪镇；撤销北赵川乡、桃坪乡、月日乡、花瓶子乡乡的建制，相应设立镇的建制。调整后，丹凤县辖16个镇：龙驹寨镇、庾岭镇、蔡川镇、峦庄镇、铁峪铺镇、武关镇、竹林关镇、土门镇、寺坪镇、商镇镇、棣花镇、月日镇、资峪镇、桃坪镇、花瓶子镇、北赵川镇。共有208个行政村，1823个村民小组。全县总人口30.2万人，其中农业人口27.71万人。
2012年末，丹凤县面积2407.4平方千米，户籍人口309187人，常住人口29.53万人。
根据陕民发[2014]57号、陕民发[2015]9号、商政民发[2015]15号文件，撤销资峪镇、月日镇、龙驹寨镇，设立龙驹寨街道，街道办事处驻凤麓社区；撤销北赵川镇，并入武关镇，镇政府驻武关村；撤销桃坪镇，并入峦庄镇，镇政府驻街坊社区；将商镇留仙坪村、油房街村、页山村并入蔡川镇；将花瓶子镇双河村并入铁峪铺镇李山村，将土门镇东楼村、八龙庙村并入竹林关镇；竹林关镇政府驻地由竹林关村迁至丹水社区；在原月日镇、桃坪镇、北赵川镇政府所在地分别设立便民服务中心；全县撤并51个村、4个居委会，保留132个村、23个社区。调整后，丹凤县辖龙驹寨1个街道和商镇、棣花、铁峪铺、武关、竹林关、土门、蔡川、庾岭、峦庄、寺坪、花瓶子11个镇，共有132个行政村、23个社区。