古称州来，又谓下蔡。清雍正十一年（1733）分寿州置凤台县，治寿州城内。据《风台县志》：“以县北之凤凰山，名县曰风台。”据《清一统志》：“县有凤凰台，相传曾有凤凰至，因名凤台。”同治二年（1863年）冬移县治于下蔡（今城关镇），下蔡遂改名为凤台，属凤阳府。
民国初，废州府，本县直隶安徽省，民国三年（1914年）6月属淮泗道（道尹驻凤阳）。民国十七年8月，废道，直隶安徽省。民国二十一年10月，属第四行政督察区。民国二十七年属第七行政督察区。抗日战争胜利后属淮南专员公署。1949年1月12日，凤台县解放，属阜阳专区。1977年1月20日交由淮南市领导。
1996年，凤台县面积1088平方千米，人口63.3万，辖6镇12乡，县政府驻城关镇。
1997年，设立古店乡，将顾桥乡的古店、南芹、北芹、王大、友谊、北王集、米集、童圩、童集、前刘、新河、东林、西林13个村划归古店乡管辖，乡政府驻古店；设立关店乡，将丁集乡的关店、向桥、蔡庄、幸福、常楼、陈庙、前老、大程、赵埔、周庄、瓦房、竹园、辛圩13个村划归关店乡管辖，乡政府驻关店。调整后，凤台县辖城关镇、大山镇、毛集镇、新集镇、岳张集镇、朱马店镇、刘集乡、杨村乡、桂集乡、尚塘乡、集岗乡、李冲回族乡、顾桥乡、关店乡、古店乡、丁集乡、大兴集乡、夏集乡、钱庙乡，共6个镇、14个乡。（13个居委会、279个村委会）
2000年第五次人口普查，全县总人口683421人，其中：城关镇48149人，大山镇18147人，新集镇56226人，朱马店镇37952人，岳张集镇43128人，毛集镇50034人，城北乡38531人，李冲回族乡16480人，刘集乡38309人，桂集乡38083人，顾桥乡25863人，古店乡27053人，钱庙乡34178人，杨村乡30041人，尚塘乡37071人，丁集乡28104人，关店乡22482人，大兴集乡27862人，夏集乡27455人，焦岗乡38273。
2002年，面积1100平方千米，人口69.25万人，辖7个镇、13个乡，16个居委会、277个行政村。2003年，面积1100平方千米，人口69.83万人，辖7个镇、13个乡，16个居委会、277个行政村。
2004年底，凤台县面积1095.62平方千米，人口71.07万人，辖7个镇、13个乡：城关镇、大山镇、新集镇、岳张集镇、朱马店镇、顾桥镇、毛集镇、刘集乡、杨村乡、桂集乡、尚塘乡、李冲回族乡、城北乡、关店乡、古店乡、丁集乡、大兴集乡、钱庙乡、焦岗乡、夏集乡。共有15个社区、274个行政村。
2005年，面积1095.62平方千米，人口72.12万人，辖7个镇、13个乡，15个社区、272个村委会。2006年，面积894平方千米，人口59.98万人。辖6个镇、11个乡，10个社区、232个行政村（均不含毛集、夏集、焦岗三个乡镇）。