全县面积8300平方千米，人口6.8万。辖1镇18乡，县政府驻南木林镇。（根据《中国政区大典》整理）
南木林镇 县政府驻地。藏语意为“全胜洲”。1960年建南木林区，1988年改镇。面积219平方千米，人口0.54万。公路南通日喀则市，东通拉萨市尼木县。辖仁欧、雪麦、雪堆、嘎布、岗巴、孔阿、卡娃、米如8个行政村。古迹有噶典曲果寺。
艾玛乡 藏语意为“哎呀!在这样一个地方”。1962年1月从日喀则市划归南木林县，设立艾玛岗区，1988年3月撤区并乡时改艾玛乡。位于县境南部，距县政府50千米。面积264平方千米，人口0.55万。辖恰热、龙穷、德、拉布、阿荣、德庆、吉雄、山巴、夏嘎9个行政村。1990年划为自治区“一江两河”综合开发区。
白玛当乡 “白玛当”系藏语意为“莲花顶”。1960年设白玛当乡，1967年改公社，1984年复置乡。位于县境中部，距县政府14千米。面积172平方千米，人口0.2万。辖白玛当、多龙、岗嘎、吉龙4个行政村。
查尔乡（Cha'er） 藏语中“查尔”是一种姓氏。1960年设查尔乡，1967年改公社，1984年复置乡。位于县境南部，距县政府68千米。面积275平方千米，人口0.24万。辖白嘎、森丁、拉龙、确龙、江嘎、恰热6个行政村。
多角乡 “多角”系藏语，意为“讲经的地方”。1960年建多角区，1988年改乡。位于县境南部，距县政府22千米。面积226平方千米，人口0.47万。辖多角、冲堆、洞祖、央、康沙、娘木、仲莎、昌木、扎西孜、仲康10个行政村。
达那乡 “达那”系藏语，意为“虎鼻”。1960年设达那乡，1970年改公社，1984年复置乡。位于县境中部，距县政府16千米。面积245平方千米，人口0.23万。辖达那、孔朗、塔中、塘果4个行政村。
达孜乡 “达孜”系藏语，意为“老虎山”。清朝初为邬郁宗，1960年设达孜乡，1967年改公社，1984年复置乡。位于县境东南部，距县政府76千米。面积248平方千米，人口0.4万。辖嘎布、恰萨、空欧、日琼、达孜、康玛、康吉7个行政村。
甲措乡 藏语意为“大海”。清朝初期称甲措溪卡，1960年建立甲措区，1988年撤区并乡后改为甲措乡。位于县境西北部，距县政府32千米。面积370平方千米，人口0.43万。辖果拉、唐巴雪、加热、藏叶、则嘎、贡巴、拉亚、扎、白甲、拉龙、甲措雪11个行政村。
卡孜乡 “卡孜”系藏语，意为“城堡的房顶”。1962年1月从日喀则市划归南木林县，1988年12月建卡孜乡。位于县境西南部，距县政府16千米。面积254平方千米，人口0.53万。辖卡孜、普、夏角、墨星、康马、孜拉、鲁古东、普章岗、聂鲁岗9个行政村。
拉布普乡 “拉布普”系藏语，意为“天神儿子的谷地”。1960年建立拉布区，1988年改乡。位于县境东北部，距县政府68千米。面积915平方千米，人口0.17万。辖东娘、普、白、采穷、达那5个行政村。
芒热乡 “芒然”系藏语，意为“很多的牛圈、羊圈”。1961年9月设立芒芜区，1978年更名芒热区，1988年撤区并乡后设芒热乡。位于县境东部，距县政府92千米。面积737平方千米，人口0.3万。辖石木、加欧、央木日、格桑、朗空、仁宗、堪珠、扎热8个行政村。
奴玛乡 “奴玛”系藏语，意为“西面”。1960年设奴玛乡。位于县境东南部，距县政府96千米。面积244平方千米，人口0.3万，南距318国道14千米。辖奴玛、热拉、塔仲、扎雄、通嘎、普阿、嘎仓、牛古8个行政村。
普当乡 “普当”系藏语，意为“山沟泥滩”。1960年设普当乡。位于县境西部，距县政府43千米。面积467平方千米，人口0.27万。辖普当、朗龙、米龙、西嘎、娘热、普堆6个行政村。
秋木乡 1960年建秋木乡。位于县境西部，距县政府14千米。面积282平方千米，人口0.24万。公路北到县城，南可达日喀则市。辖别多、扎林、敏国、班宗、奶沙、扭西、藏东、麦故普8个行政村。
热当乡 “热当”系藏语，意为“山羊坝”。1960年建热当乡。位于县境中部，距县政府驻地34千米。面积591平方千米，人口0.7万。辖莎马、热让、梅热森、珠布加、吉吾、孜、波多、达吉、凯热、连堆、切扎、嘎典、阿措、奶果14个行政村。
仁堆乡 1961年建仁堆乡。位于境西北部，距县政府75千米。面积351平方千米，人口0.12万。辖洛扎、普拉、吉五3个行政村。
索金乡 “索金”系藏语，意为“大蒙古部落”。1960年1月建索金乡。位于县境东部，距县政府69千米。面积389平方千米，人口0.32万。辖白龙、白沙、宁布、巴相、嘎孜、桑木林、顿木觉、亚木、差嘎尔、欧布多10个行政村。
土布加乡 “土布加”系藏语，意为“胜利”。1962年1月从日喀则市划归南木林县，设立土布加区，1988年3月撤区并乡时改乡。位于县境南部，距县政府86千米。面积495平方千米，人口0.53万。辖马格达、朗布、岗沙、顶布、果西、连珠、门康、曲龙、江麻坚、岗嘎、差那、夏尔雪、夏如、东普14个行政村。八世达赖强曲嘉措出生于此地。
孜东乡 1960年设孜东乡，1962年1月从日喀则市划归南木林县。位于县境南部，距县政府61千米。面积154平方千米，人口0.25万。辖由西、夏麦、拉遵、达夏、奴堆、雪奴6个行政村。