春秋为宋国地。秦属泗水郡。西汉改为沛郡，东汉为沛国。唐元和四年(809)割徐州之符离、蕲县及泗州之虹县置宿州，治设埇桥，宿州之名始此。据《史记》：“殇公秋立，封孙文子林父于宿。”据《元和郡县志》：宿州“取古宿国为名”。1912年废州为宿县。
1949年4月设宿县专区，属皖北行署区。宿县专署驻宿县，辖宿城市及宿县、灵璧、泗县、泗洪（由泗县析置，驻青阳）、五河、怀远、砀山、萧县（驻龙城镇）、永城等9县。1950年由宿县析置濉溪县，驻濉溪口。宿县专区辖1市、10县。
1952年宿县专区属安徽省领导。宿县专署驻宿城市。将砀山、萧县2县划归江苏省，永城县划归河南省。1953年撤销宿城市，并入宿县。1955年萧县、砀山2县由江苏省划入安徽省宿县专区；将泗洪县划归江苏省淮阴专区。1956年撤销宿县专区，将宿县、灵璧、泗县、五河、怀远、濉溪、萧县、砀山等8县划归蚌埠专区。
1961年复设宿县专区，专署驻宿县。原蚌埠专区所属宿县、灵璧、泗县、五河、怀远、濉溪、萧县、砀山等8县划入宿县专区。1964年以宿县、灵璧、五河、怀远4县各一部分地区设立固镇县（驻固镇）。
1970年宿县专区改称宿县地区，地区驻宿县。辖宿县、砀山、萧县（驻龙城镇）、灵璧（驻灵城镇）、泗县、五河、固镇、怀远、濉溪等9县。1977年将濉溪县划归淮北市领导。1979年设立宿州市，属宿县地区领导。
1983年10月8日，国务院批准同意将宿县地区的怀远县、固镇县、五河县划归蚌埠市。宿县地区1997年，面积9795平方千米，人口532.8万，辖宿州市和砀山、萧县、灵璧、泗县4县。行署驻宿州市。
1998年12月6日，国务院批准：（1）撤销宿县地区和县级宿州市，设立地级宿州市。市人民政府驻新设立的埇桥区。（2）宿州市设立埇桥区，以原宿州市的行政区域为埇桥区的行政区域。（3）宿州市辖原宿县地区的砀山县、萧县、泗县、灵壁县和新设的埇桥区。
2000年第五次全国人口普查，宿州市总人口5516423人；埇桥区1601181人，砀山县862356人，萧县1196377人，灵壁县1051325人，泗县805184人。
2004年底，全市共有11个街道、72个镇、27个乡。