牡丹江市总面积40435平方千米，总人口270万人。辖东安、阳明、爱民、西安4个市辖区和东宁、林口2个县，代管绥芬河、海林、宁安、穆棱4个县级市。市政府驻爱民区。（面积数据根据《中华人民共和国行政区划简册2012》，人口为2010年户籍人口）
东安区面积566平方千米，人口19万人。辖5个街道：新安街道、长安街道、七星街道、五星街道、兴隆街道。区政府驻新安街道。
阳明区面积358平方千米，人口23万人。辖4个街道、4个镇：阳明街道、前进街道、新兴街道、桦林橡胶厂街道、铁岭镇、桦林镇、磨刀石镇、五林镇。区政府驻阳明街道。
爱民区面积359平方千米，人口23万人。辖7个（一说8个）街道、1个乡：向阳街道、黄花街道、铁北街道、新华街道、大庆街道、兴平街道、北山街道、北安乡（街道）。区政府驻向阳街道。
西安区面积430平方千米，人口24万人。辖6个街道、1个镇、1个民族乡：先锋街道、火炬街道、立新街道、牡丹街道、江滨街道、沿江街道、温春镇、海南朝鲜族乡（一说有7个街道，另一个是水泥街道）。区政府驻先锋街道。
东宁县面积7368平方千米，人口21万人。辖6个镇：东宁镇、三岔口镇、大肚川镇、老黑山镇、道河镇、绥阳镇。绥阳林业局在境内。县政府驻东宁镇。
林口县面积7191平方千米，人口38万人。辖9个镇、2个乡：林口镇、古城镇、刁翎镇、朱家镇、柳树镇、三道通镇、龙爪镇、莲花镇、青山镇、奎山乡、建堂乡。县政府驻林口镇。
绥芬河市面积427平方千米，人口7万人。辖2个镇：绥芬河镇、阜宁镇。市政府驻绥芬河镇长江路1号。
海林市面积9772平方千米，人口41万人。辖8个镇：海林镇、长汀镇、横道镇、山市镇、柴河镇、二道镇、新安朝鲜族镇、三道镇。市政府驻海林镇。
宁安市总面积7870平方千米，人口44万人。辖7个镇、5个乡（其中3个民族乡）：宁安镇、东京城镇、渤海镇、石岩镇、沙兰镇、海浪镇、兰岗镇、江南朝鲜族满族乡、卧龙朝鲜族乡、马河乡、镜泊乡、三陵乡。市政府驻宁安镇。
穆棱市面积6094平方千米，人口33万人。辖6个镇、2个乡：八面通镇、穆棱镇、下城子镇、马桥河镇、兴源镇、河西镇、福录乡、共和乡。市政府驻八面通镇。