全县辖2个镇、9个乡，5个居委会、125个行政村。县政府驻萨迦镇。
萨迦镇 辖5个居委会、6个行政村：桑木林、夏尔巴、宗果、帕措、奴巴；索西村、普夏村、多夏村、查龙村、卡吾村、赤龙村。
吉定镇 辖15个行政村：帕定村、求果嘎村、江色村、培金村、杂达村、冲达村、丹丹村、加木村、察贡村、米村、桑珠村、白色村、吉定村、克赤村、龙桑村。
木拉乡 辖7个行政村：吉村、查马村、达江村、木拉村、央果村、培玛村、拉顿村。
查荣乡 辖14个行政村：拉雄村、拉热村、尼康村、加布玉村、松多村、江贡村、曲多村、帕林村、恰龙村、苦堆村、江雄村、夏嘎村、巨麦村、苦麦村。
拉洛乡 辖17个行政村：塔村、秋桑村、觉村、多白村、章吉村、拉多村、加布村、帮村、达普村、色瓦村、德吉村、多才村、秋洛村、初组村、达那村、洛定村、卡玉村。
赛乡 辖9个行政村：嘎果村、顿热村、帕度村、知布达村、帮白村、恰白村、帕宁村、夏吾村、西贡村。
扯休乡 辖14个行政村：东耐村、扯休村、乃夏村、巴定村、斯马村、朗巴吉村、赛贵村、桑培村、乃村、陈村、申雄村、康坚村、甲琼村、吉雄村。
扎西岗乡 辖11个行政村：雪荣村、玉莎村、扎西岗村、伦珠定村、查吾村、扎西布村、次多村、达布仁村、东克布村、查玛村、江堆村。
雄玛乡 辖14个行政村：吉堆村、旺堆村、加布堆村、雄马村、德庆孜村、琼孜村、吉麦村、杰堆村、德莎村、德布村、夏布堆村、强贵村、江嘎村、申克孜村。
麻布加乡 辖9个行政村：白拉村、白色村、麻布加村、朗金村、拉东村、秋雪村、普玛村、帕列村、普村。
雄麦乡 辖9个行政村：曲堆村、嘎布切村、杂果村、通门村、玉琼村、岗雄村、曲卡村、雄麦村、格白村。