萨迦县位于西藏自治区南部、日喀则地区中部、雅鲁藏布江南岸。东与日喀则市、白朗县接壤，南与定结、岗巴两县相连，西与拉孜、定日毗邻，北与谢通门隔江相望。县城距日喀则市150千米。总面积7510平方千米。户籍总人口46118人（2007年末）。
地处喜马拉雅山和冈底斯山之间，地势南北高，中部低。境内最高峰海拔6092米。有冲曲河、夏布曲河等河流。属高原温带半干旱季风气候。无霜期110天左右，年均温0℃，年降水量350毫米。中尼公路过境。是以农业为主的半农半牧县。境内有建于1288年的萨迦寺，1961年被列为国家重点文物保护单位；还有白玛曲林、超浦、举巴、康坚、仁钦岗寺等各教派的寺庙。一世达赖喇嘛根敦珠巴，1391年生于萨迦县境内的霞堆牧场。