2004年，霍邱县乡镇由36个调整为35个（22个镇、13个乡）：撤销朱港乡，将朱港乡整建制并入周集镇；保留城关镇、姚李镇、洪集镇、曹庙镇、众兴集镇、夏店镇、乌龙镇、户胡镇、龙潭镇、石店镇、冯井镇、临水镇、高塘镇、岔路镇、新店镇、孟集镇、花园镇、宋店乡、三流乡、城西湖乡、临淮岗乡、邵岗乡、白莲乡、范桥乡、王截流乡、潘集乡、彭塔乡、冯瓴乡、马店镇、长集镇、河口镇。（六安市政府六政秘[2004]115号批复）（霍邱县2004年11月20日批准）
附：2004年9月20日，六安市人民政府向省政府上报《关于霍邱县乡镇行政区划调整的请示》（六政[2004]41号）。部分文件内容：……霍邱县现有33个乡镇（21个镇、12个乡），680个村，26个居民委员会，总面积3493.2平方千米，总人口1492413人，平均每乡镇105.85平方千米，人口4.52万人。……拟将现有33个乡镇调整为32个乡镇（21个镇，11个乡）。具体方案如下：
一、撤销朱港乡。
二、调整周集镇的行政区域。
将原朱港乡整建制并入周集镇。调整后，周集镇辖30个村（居）委会，174个村民小组，总面积104.05平方千米，总人口74718人。镇政府驻周集（原周集镇政府驻地）。
三、保留城关、姚李、洪集、曹庙、众兴集、长集、夏店、河口、乌龙、户胡、龙潭、马店、石店、冯井、临水、高塘、岔路、新店、孟集、花园20个镇和宋店、三流、城西湖、姜家湖、邵岗、白莲、范桥、王截流、潘集、彭塔、冯瓴11个乡。
保留马店、长集、河口3个镇的理由：
马店镇系省级中心镇，面积92.86平方千米，20个村，人口38208人。该镇地处大别山余脉，境内安阳山海拔419.4m，且多以低山和丘陵地貌为主，是典型的丘陵地区。该镇矿产资源丰富，区域内矿产企业众多，发展空间大，又与河南省相邻，为确保边界地区稳定，有利于“边贸”经济发展和矿产资源的开发。因此，予以保留。
长集镇是省级中心镇，总面积71.74平方千米，人口32579人，17个村。与其相邻的几个乡镇都不宜并入长集镇。众兴集镇若并入长集镇，南北长30千米，区域过分狭长，不便管理；夏店镇与长集镇分属东、西湖蓄洪区，如果合并将形成一个新的重灾乡镇，影响经济发展。因此，予以保留。
河口镇现有面积49.41平方千米，15个村（居）委会，26189人。该镇历史悠久，明万历年间即称两河口。该镇商贸繁荣，非农人口比例大，如果撤销河口镇，将其整建制并入其他乡镇，会导致河口镇商贸流通萧条。若将邻近乡镇并入河口均不合适。因此，继续保留。
调整后，霍邱县辖21个镇11个乡，乡镇平均人口4.66万人，平均面积109.16平方千米。